理論生物学

２０２４/ Ｓ１

生体は、その素過程である細胞レベルから多様なダイナミクスと様々な機能を有する。

近年イメージングやシーケンシングの発展によりこれらの動態を定量的に計測・解析できるようになっていることを背景として、複雑な細胞や細胞集団のダイナミクスを理解するための数理が生命科学においてますます重要になっている。

本授業では、その基礎となる細胞を単位とした生体システムの数理解析手法と関連トピックを概説する。

細胞システムの数理モデルの理解と解析に不可欠な反応速度論、そしてそれを応用した生体機能の理論解析の例として、非線形応答やロバスト性、自己複製に付随する普遍則などを扱う。

またデータからの細胞動態の推定は、バイオインフォマティクスにおいても重要な課題になってきている。これらに関連する分化動態解析やRAN velocity、そして発生ランドスケープ解析についても解説する。

履修とZoomでのオンライン授業参加のために以下の設定をお願いします：

東大生はUTACのアカウントでZoomにログインしてください(やり方)。
1. Zoomの接続情報は、ITC-LMSにアップしてあります(理学部, 新領域)。
2. 聴講の方で東大UTACアカウントを持っていない人は個人のZoomアカウントで構いません。
授業の情報共有およびトピックの選定行う関係で、アンケート(授業中にチャットでリンクは伝えます)にお答えください。
1. 参加希望の方は授業に参加いただくか、個別にメールをいただければ対応します。
2. ガイダンスに出れなかった人は、ITC-LMSに上記アンケートのリンクをおいてあるのでそちらを御覧ください
履修関係 (聴講の方は不要です)
1. 出席管理および授業のZoomのパスワード共有にITC-LMSを使います。単位が必要な東大の方はこちらからログインして、「理論生物学(0560540 or 47240-45)」を登録してください。
2. 履修の正式登録はUTAS上で行います。履修する方はUTASでの手続きをお願いします。
3. 聴講の方は情報をアンケートで登録したEmailに送ります。
資料
1. 下記の講義予定内容のところに本日資料のリンクがあります。ダウンロードしてください(PWはzoom内で連絡します)。

初回(4月9日)は以下を行う

1：ガイダンス,

2：細胞システムのダイナミクスと機能：数理と情報の観点から(Introduction)

以降、下記よりトピックを受講者のバックグラウンドなどを考慮して、理論生物的トピックと生物情報学的トピックがある程度バランスするように選択します：

今年度取り上げないトピックの一部については、前年度講義動画のオンデマンドマテリアルも受講者には提供します。

各種マテリアルは、初回ガイダンスでのECCS or gmailアカウント登録後にアクセス可能になります

注：各種マテリアルは、初回ガイダンスでのECCS or gmailアカウント登録後にアクセス可能になります

各種マテリアルは、初回ガイダンスでのECCS or gmailアカウント登録後にアクセス可能になります

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