参考図書のリスト

小林研の志望者、もしくは小林の授業受講者向けの参考図書のリストです。

Last update (30/Oct/2019)

「実験医学 2013年5月号: 生命システムを定量する!」小林徹也企画
- 私が企画した特集です。概要に我々が目指す定量的な生命科学研究の展望などが概説されています。
「ウェットウェア: 単細胞は生きたコンピューターである」 by デニス・ブレイ
- 考え方や発想は私のイメージしているものとかなり近いです。これをもっと理論的に先鋭化した感じか。講演もネットで見れます。
「サイバネティックス」 by ノーバート・ウィーナー
- 古い本ではありますが、発想としては非常に近いと思っています。「動物と機械」を「細胞と微小機械」と読みかえればよいかと。

「Physical Biology of the Cell」
- 生物プロパーの人も勉強して損はないと思います。そんなにまだ分厚くないし。
「Cell Biology by Numbers」
- 副読本としておすすめです。
「定量生物学」DOJIN BIOSCIENCE SERIES、小林徹也(編)
- 定量生物学関係の仲間と編集した教科書です。定量生物学のトピックを個別にreviewするのに適していると思います。

「学習院の田崎さんが公開されているテキスト」
- とても良くできていて自習におすすめです
- 数学の各分野のテキストは色々有りますが、その内容は数学専門家用から応用向けまでスペクトルが有ります。無理をせず自分の理解が追いつく教科書からステップアップすることが大事です。

「生命科学の新しい潮流理論生物学」望月敦史 (編集)
- 自分も寄稿しています。オムニバスですが非常によい専門書だと思います。
「システム生物学入門 -生物回路の設計原理-」 by ウリ・アロン
- 定番ではありますが、一度読んでおいたほうがよいでしょう。英語の原版は第2版になっており、最新の内容が多く含まれています。
「Biophysics: Searching for Principles」 William Bialek (著)
- 神経よりではありますが、理論的な部分もかなり記載された良い教科書だと思います。厚いですが。。
「Stochastic Processes in Cell Biology」(Interdisciplinary Applied Mathematics, Paul C. Bressloff (著)
- 確率過程に基づく細胞現象のモデリングや解析について、広くまとまっている教科書です。

「Stochastic Methods: A Handbook for the Natural and Social Sciences」 Crispin Gardiner (著)
- 確率過程の解析法の基本的な教科書で必読だと思います。
「確率論の基礎概念」 A. N. コルモゴロフ (著), 坂本實 (翻訳)
- 確率論の基礎概念を確認するのに良い本だと思います。
「The Fokker-Planck Equation」 Hannes Risken (著), Till Frank (著)
- すこしマニアックですが価値のある専門書だと思います。
「Noise-Induced Transitions」,Springer Series in Synergetics, W. Horsthemke (著)
- Gardinerの教科書と比べるとマイナーですが、個人的には結構好きな教科書です。
「Point Processes and Queues: Martingale Dynamics」, Springer Series in Statistics, P. Bremaud (著)
- 絶版ですが、マルチンゲールの視点からの点過程の入門に良い教科書だと思っています。

「情報理論の基礎」村田昇 (著)
- コンパクトにまとまっていて、情報理論関連の良い入門書だと思います。
「情報理論 (ちくま学芸文庫)」甘利俊一 (著)
- 古いですが、今も色あせない甘利先生の名著です。
「通信の数学的理論 (ちくま学芸文庫)」クロード・E. シャノン (著), ワレンウィーバー (著), 植松友彦 (翻訳)
- 情報理論の歴史的名著。必読。
「情報理論 -基礎と広がり-」 Thomas M.Cover (著), Joy A.Thomas (著), 山本博資ほか (翻訳)
- かなり大分ですが情報理論の様々なトピックを網羅しています。

「Stochastic Energetics」 Ken Sekimoto (著)
- 生物に関連するStochastic thermodynamicsの専門書です。
「Thermodynamics of Information Processing in Small Systems」 Takahiro Sagawa (著)
- コンパクトにまとまっていて、初めてこの分野を勉強するための良い本になっています。